中国科技信息技术研究所于2012年12月7日在京发布“2012年中国百篇最具影响力的国内论文”，由中国医科院药植所陈士林编委撰写、由肖培根院士评述、发表在2009年第5期《中国天然药物》的“思路与方法：中药资源学研究”专栏的“药用植物DNA条码鉴定策略及关键技术分析”一文获此殊荣。我国每年发表国内论文54万篇，“百篇论文”荣誉来之不易，它已成为显示作者研究机构及论文发表期刊学术影响力的重要标志之一。这篇文章是编委会重点打造的“思路与方法”品牌栏目的约稿文章，在2012年被引19次，充分显现了《中国天然药物》的内容策划力与学术影响力。

《中国天然药物》“思路与方法”栏目以“大师写给专家阅读的文章”定位，每期针对重要领域、关键技术等热点难点议题，由三篇大师级专家从不同角度阐述学术观点，一位院士评述，编辑部撰写编者按及导读，本栏目共出版22期专栏、两个专辑，已有22位院士在此栏目中发表数十篇文章，单篇下载最多近3000次，成为中国药学会期刊中论文被下载与引用最多的栏目之一，多次被评为“品牌栏目”、“优秀栏目”，已成为科技期刊作为科技思想库发挥引导力、传播力与影响力作用的成功示范。陈士林研究员在国际上首次验证并提出ITS2作为药用植物鉴定的通用DNA条形码序列，他通过全基因组解析提出灵芝为中药活性成分生物合成研究的首个药用模式真菌的论文发表在《自然》子刊Nat Comms上, 2012年8月被Nature网站选为中国最佳研究作为亮点推介。《中国天然药物》2009年就此技术的组稿，显示了编辑团队对关键前沿技术的科学预见能力。

《中国天然药物》编辑部近几年通过内容策划、专家约稿、热点导读及与编委机构的深度合作等途径，不断提升期刊的学术影响力，仅2012年就连续获得“中国精品科技期刊”、“中国科协精品科技期刊”、“中国高校优秀期刊”“中国权威学术期刊”、“中国最具国际影响力期刊”“江苏省首届新闻出版政府奖”等多项荣誉，并被国际权威检索系统SCI、MEDLINE收录。“百篇论文”的获得再一次展示了《中国天然药物》杂志在中药与天然药物研究领域的权威地位，同时也说本刊的国内外学术影响力逐年增强。